雖然人們普遍認(rèn)為VR(虛擬現(xiàn)實(shí))設(shè)備是僅限于專門的游戲玩家使用的昂貴產(chǎn)品,但近年來VR設(shè)備已經(jīng)越來越便宜,入門級硬件(如Google Cardboard)的價格不到10美元。有了這種頭盔,任何擁有智能手機(jī)的人都可以將他們的設(shè)備放入頭盔,并通過其大屏幕觀看VR內(nèi)容。
隨著門檻大大降低,科學(xué)家和工程師們正試圖將VR帶給大眾,并利用它來解鎖突破性的發(fā)現(xiàn)。來自美國一些頂級醫(yī)療中心和機(jī)構(gòu)的一個研究團(tuán)隊現(xiàn)在在《遺傳學(xué)前沿》上發(fā)表了一篇論文,記錄了他們創(chuàng)建的名為“singlecellVR”的VR工具,它可以供任何人探索單細(xì)胞的數(shù)據(jù)集。
這個免費(fèi)、開放的網(wǎng)絡(luò)應(yīng)用允許任何人在VR中輕松實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞檢測的可視化,而且還不需要用戶具備高級技術(shù)技能。單細(xì)胞檢測改變了人們在細(xì)胞群內(nèi)建立異質(zhì)性模型的能力,有助于在更大的細(xì)胞群中確定單個細(xì)胞的功能和行為。
獲得這些數(shù)據(jù)并確定細(xì)胞狀態(tài)和基因至關(guān)重要,它可以幫助科學(xué)家更好地進(jìn)行理解,包括各種癌癥在人體中的傳播方式。
以前的工具非常昂貴,成本高達(dá)2500美元以上。然而,singlecellVR建立在以前的VR進(jìn)展之上,允許用戶直接通過最常用的單細(xì)胞分析工具(包括Scanpy、Seurat、PAGA、STREAM、scVelo和EpiScanpy)將他們自己預(yù)先計算的數(shù)據(jù)可視化。
基于智能手機(jī)的VR頭盔在用戶導(dǎo)航和與數(shù)字環(huán)境的互動方面受到限制,但研發(fā)人員說,增加一個便宜實(shí)惠的藍(lán)牙鍵盤或控制器(大約20美元)可以帶來更好的體驗。
展望未來,該團(tuán)隊認(rèn)為singlecellVR將會有更多單細(xì)胞技術(shù)相關(guān)的應(yīng)用(例如多組學(xué)或空間剖析),它們期望singlecellVR能擴(kuò)大對更強(qiáng)大設(shè)備的支持,例如Facebook的Oculus VR頭盔,其成本約為300美元。
該研究論文題為"singlecellVR: interactive visualization of single-cell data in virtual reality",已發(fā)表在《遺傳學(xué)前沿》期刊上。
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參考資料:https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fgene.2021.764170/full